Håndplukning er den mest skånsomme og præcise metode til høst af kaffebær. Arbejdet udføres manuelt, hvor plukkerne kun vælger de modne, røde bær og lader de grønne modne færdig. Dette sikrer ensartet kvalitet og optimal smagsudvikling. Metoden kræver stor erfaring og omhyggelighed, da modningen ikke sker samtidig på alle grene. Håndplukning bruges især i specialty-produktion, hvor kvalitet vægtes over kvantitet. Selvom metoden er tidskrævende og dyrere end maskinhøst, giver den bedre kontrol over råmaterialet og mindre risiko for defekte bønner. I mange kaffeproducerende lande er høsten en social begivenhed, hvor familier og lokalsamfund arbejder sammen i sæsonen. Resultatet er kaffe med højere kvalitet og sporbarhed – et håndværk, hvor hvert bær har været udvalgt med menneskelig omhu.